贯彻执行国家医疗机构、医疗技术应用、医疗质量和安全、医疗服务、医疗监督、采供血机构管理以及行风建设等行业管理政策、规范、标准，拟订自治州实施办法并组织实施；贯彻落实国家药物政策，执行国家药品法典。负责开展药品使用监测、临床综合评价和短缺药品预警；落实卫生健康科技发展规划及相关政策并组织实施；承担推进心理健康和精神卫生、护理、康复事业发展工作；拟定公立医院运行监管、绩效评价和考核制度。